Tras su derrota ante Nitta Yoshisada en 1336, Ashikaga Takauji restauró por completo sus fuerzas y se aseguró el apoyo de tres poderosos clanes de Kyushu: los Sōni, los Shimazu y los Otomo. Además, recibió importantes refuerzos de la isla de Shikoku bajo el mando de Hosokawa. Habiendo reforzado así su ejército, Ashikaga Takauji marchó sobre Kioto.
El castillo de Tihaya fue construido por Kusunoki Masashige en la cima del monte Kongo, separado de las colinas vecinas por un profundo barranco. El terreno en sí mismo proporcionaba una protección natural, lo que hacía que la posición fuera extremadamente conveniente para la defensa.
Kusunoki Masashige, héroe de la rebelión Genko (1331-1333), fue un comandante talentoso y un estratega ingenioso. Los dos asedios a castillos en los que actuó como defensor están inscritos con letras de oro en la historia del arte militar japonés.
Tras la muerte de Minamoto no Yoshinaka, la guerra Genpei entró en su fase final, estrechamente relacionada con el nombre de Minamoto no Yoshitsune. El 13 de marzo de 1184, él y su hermano Noriyori se propusieron lograr lo que su primo no había conseguido: derrotar definitivamente a los Taira.
Minamoto no Yorimasa no necesitaba un pretexto especial para que su creciente hostilidad hacia el clan Taira se convirtiera en abierta rebelión. En la corte también se encontraba el descontento príncipe Mochihito, segundo hijo del ex-emperador Go-Shirakawa. Ya había sido pasado por alto dos veces en la sucesión al trono. La segunda vez ocurrió en 1180, cuando coronaron al joven Antoku. Así, Taira no Kiyomori, jefe del clan Taira, se convirtió en abuelo del emperador.
El conflicto entre los clanes Soga y Mononobe, emparentados con la dinastía imperial, surgió por motivos religiosos. Los Soga apoyaban el budismo, que había llegado desde Corea, mientras que los Mononobe se mantenían fieles al sintoísmo y se oponían ferozmente a la difusión de «enseñanzas extranjeras». Las tensiones alcanzaron su punto álgido tras la muerte del emperador Yomei en 587.